ECAP (Estación Clínica de Atención Primaria)

Es la plataforma de la historia clínica de Atención Primaria de Cataluña. Utiliza los diagnósticos codificados con CIE-10-MC y los variables propios.

Enfermedades respiratorias agudas

Población de residencia

Histórico de censo hospitalario

Ingresos en hospitales de Cataluña, sólo disponible desde el 29/04/2020

Ingresados

Declaración numérica

Registro Sanitario Agregado (RSA) de Salud

Registro centralizado de PCR/TAR del sistema público de Salud.

PCR

Defunciones

Orfeu

Programa pera el registro de PCR/TAR, que inicialmente se utilizó para solicitar y registrar los PCR/TAR de los profesionales sanitarios y de los cribados de residencias

PCR

Registro central de asegurados del CatSalut

Registro de asignaciones de las personas a sus equipos de atención primaria

Población

Edad

Género

Territorio

Aplicativo piloto censo de residencias

Aplicativo que contiene el censo actualizado de las personas residentes en residencias geriátricas, de momento en fase piloto sólo en algunos centros

Población de residencia

Història Clínica Compartida de Cataluña (HC3)

Dónde se introducen las dosis administradas de la vacuna para el SARS-CoV-2

Vacuna SARS-CoV-2

Censos profesionales

Registro de censos profesionales sanitarios y de trabajadores esenciales

Coberturas vacunales por grupos

Registro del grado de dependencia reconocido

Registro de personas con gran dependencia del Departament d'Afers socials i Famílies a fecha de 31/12/2020

Coberturas vacunales por grupos (grupo 4)

Grupo de indicación de la vacuna

Grupos abiertos porpuestos por el Ministerio de Sanidad. Las pesonas se asignan de forma gerárquica en estos grupos. Por ejemplo: una persona institucionalizada de 85 años está en el grupo (1A) Institucionalizados y no en el grupo (5A) Personas de 80 años o más. Actualmente la asignación a los grupos es por cohorte de nacimento.

PCR

Cuando un profesional sanitario pide una PCR, tarda en llegar un tiempo que puede variar entre horas o días. La página web incorpora las PCR a medida que recibe los resultados y estos se imputan al día en que se realizó la prueba. Por eso el número de PCR/TAR puede incrementar de forma retrospectiva.

Es por este motivo que la página web sólo muestra los datos de hasta 3 días antes, que es cuando ya están publicadas la mayoría de las PCR, aunque un número variable se puede publicar en días posteriores.

Infecciones respiratorias agudas

A la hora de realizar el diagnóstico en la historia clínica, se puede especificar el día de inicio de la enfermedad, que puede ser anterior al día de la asistencia. Por eso, puede haber incrementos en el número de diagnósticos después de la fecha.

También puede ocurrir que, después de recibir los resultados de una prueba, se modifique el diagnóstico de infección respiratoria aguda por otro diagnóstico. En este caso, el número de infecciones respiratorias agudas en la página web disminuiría.

Defunciones

Las defunciones pueden llevar un cierto retraso en la notificación. En la página web, las defunciones se imputan al día de la defunción y no el día de la notificación. Por eso pueden aumentar de manera retrospectiva.

Población

Todas las personas residentes en Cataluña.

RCA

Población de residencia

Pacientes que están ingresados en una residencia geriátrica. Proceden de 2 fuentes diferentes:

• El censo de residencies de la ECAP y RSA
• El nuevo aplicativo en fase piloto, donde se centraliza el censo de residentes

ECAP, RSA, Aplicativo del censo de residencias (piloto)

Infección respiratoria aguda (IRA)

Se tienen en cuenta cada episodio de enfermedad respiratoria aguda que se diagnostica en la ECAP.

Los códigos diagnósticos que se tienen en cuenta son todos los relacionados con la COVID-19 (no los contactos) y los códigos diagnósticos de las IRA (ver datos complementarios).

ECAP

Neumonía

Se tienen en cuenta todos los diagnósticos de neumonía por cualquier causa registrados en la historia clínica de atención primaria

PCR/TAR (Test Antigénico Rápido)

La prueba de la PCR/TAR para la detección del SARS-CoV-2 se puede realizar en diferentes niveles: en la atención primaria, hospitalaria, laboral, salud pública... En su gran mayoría, están registradas en el RSA. Desde la ECAP se recuperan los resultados de las PCR/TAR que se hacen en el ámbito privado de los pacientes que se visitan en atención primaria.

Las PCR/TAR se usan en general para confirmar un caso de sospecha de COVID-19 o para hacer un cribado de los contactos de un caso confirmado y para hacerles un seguimiento. El resultado de la prueba puede tardar entre unas horas y unos días en llegar, según el lugar en el que se realiza. En la página web, el resultado de la PCR/TAR se imputa a la fecha de realización de la prueba, y la cifra puede incrementar retrospectivamente a medida que se reciben los resultados de los laboratorios, como hemos comentado anteriormente.

Las PCR/TAR se imputan al territorio donde está asignado el paciente en el RCA.

RSA, Orfeu, ECAP

Caso confirmado por PCR/TAR

Paciente que tiene una PCR/TAR positiva. La fecha en la que se imputa el caso es la fecha de inicio del caso y es la fecha más antigua de estas dos:

• La fecha en que se diagnostica el problema de salud de COVID-19 en atención primaria, siempre que el diagnóstico sea 14 días antes de la PCR/TAR.
• La fecha en que llega el resultado positivo de la PCR/TAR.

Si un paciente tiene más de un diagnóstico de COVID-19, se tiene en cuenta el primero de los últimos 14 días.

Si un paciente tiene más de una PCR/TAR positiva hecha, se tiene en cuenta la primera, que es la que confirma el caso.

Para la evolución epidemiológica de la pandemia, no se tienen en cuenta los test serológicos para el estudio de la inmunidad poblacional que se inició el 29/06/2020 (variable según el territorio).

Ver PCR/TAR

ECAP para los diagnósticos de la COVID-19

Caso confirmado

Un caso se puede confirmar por PCR/TAR pero también por otros métodos que no tenemos en cuenta para el seguimiento epidemiológico pero que mostramos en el apartado de situación diaria de la población total (inicio), el del recuadro de Casos confirmados acumulados.

A parte de por PCR/TAR, los casos se pueden confirmar por:

• Epidemiológicos: son los casos en los que un epidemiólogo ha confirmado el caso.
• Casos probables, ya que tienen una alta probabilidad de confirmarse.
• Serológicos: ELISA y test rápidos que nos indican la inmunidad del paciente. No los usamos para el seguimiento epidemiológico porque no se puede determinar el día inicial del caso.

Ingresados

Pacientes ingresados por COVID-19 la última fecha del periodo mostrado.

Estos se imputan al territorio donde está asignado el paciente en el RCA.

Histórico de censo hospitalario

Ingresados en UCI

Pacientes ingresados en la UCI por COVID-19 en la última fecha del periodo mostrado.

Estos pacientes están incluidos entre los ingresados, para ingresar en la UCI se tiene que haber ingresado previamente en el hospital.

Estos se imputan al territorio donde está asignado el paciente en el RCA.

Histórico de censo hospitalario

Defunción

Las defunciones tienen las siguientes características que afectan a los datos que presentamos:

• La fecha de defunción: la fecha en que la persona muere.
• La fecha de notificación: la fecha en que la fecha de defunción se notifica en el sistema.
• El motivo de defunción. 

En el caso de la página web COVID, las defunciones se imputan a la fecha de defunción pero aparecen en la página web por primera vez el día de la notificación.

Sólo se tienen en cuenta las defunciones relacionadas con la COVID-19: que el motivo en el certificado de defunción especifique que la persona ha muerto a causa de la COVID-19 tenga o no una PCR/TAR+.

RSA

Vacunación

Número de personas vacunadas con 1 o 2 dosis

Pauta comlpleta: el criterio general es la administración de 2 dosis, con la excepción de las persones menores de 66 años que han sido caso COVID19 con anterioridad, que en ese caso es solo necesaria 1 sola dosis. Se irá modificando el criterio en función de las indicaciones vigentes.

HC3

Edad media

Es la edad media de las personas que son casos de COVID-19 confirmados, del período y territorio seleccionados.

% Mujeres

Porcentaje de mujeres de los casos de COVID-19 confirmados por PCR/TAR.

PCR/TAR hechas

recuento

Total de PCR/TAR hechas durante el período seleccionado en el territorio seleccionado.

Casos confirmados por PCR/TAR

recuento

Número de casos de COVID-19 confirmados por PCR/TAR según el período y los territorios seleccionados.

Casos confirmados acumulados

recuento

Total de pacientes con prueba diagnóstica positiva para COVID-19 acumulados desde el 1 de marzo de 2020. Se incluyen los casos confirmados por test rápidos serológicos y ELISA, PCR/TAR probable y confirmados epidemiológicos.

Pacientes ingresados 

recuento

Número de pacientes COVID-19 ingresados (prevalentes) por territorio.  

Pacientes ingresados en UCI

recuento

Número de pacientes COVID-19 ingresados en UCI (prevalentes) por territorio.

Defunciones

recuento

Número de pacientes con COVID-19 que han muerto por territorio y período seleccionados.

Tasa de infección respiratoria aguda

en el gráfico

(infección respiratoria aguda/población)×100.000

Es el indicador más precoz que hay, ya que no depende tan directamente de la tasa de PCR/TAR. Está directamente relacionado con la actividad de la atención primaria.

Tasa de neumonías

en el gráfico

(neumonía/población)/100.000

Se trata de la tasa de neumonías registradas en la atención primaria

Tasa de PCR/TAR

(número de PCR/TAR/población) × 100.000

Nos sirve para comparar el número de PCR/TAR que se están realizando entre territorios.

También depende de la tasa de casos confirmados, ya que cuantos más casos confirmados, más contactos y más PCR/TAR hechas.

Tasa de casos confirmados por PCR/TAR

(casos confirmados/población)×100.000

Esta tasa nos sirve para poder comparar los territorios entre sí.

Se debe tener en cuenta que para territorios pequeños, esta tasa puede ser inestable. 

Está estrechamente relacionada con la tasa de PCR/TAR, ya que cuantas más PCR/TAR se realizan, más casos se encuentran.

Empieza a ser fiable 3 días después de la realización de la PCR/TAR (explicado en el apartado‘Los datos son dinámicos’).

IA14 (Incidencia acumulada)

(casos confirmados en los útimos 14 días/población)×100.000

Variación de casos (%)

[(t_(-1)-t)/t_(-1)]×100

Es la variación relativa de la tasa de casos de COVID-19 confirmados por PCR/TAR del último período con respecto al anterior.

Nos indica si la tasa ha incrementado (rojo) o disminuido (verde) con respecto al período anterior.

% PCR/TAR positivas

Proporción de todas las pruebas PCR/TAR diagnósticas o por cribaje (se excluyen aquellas realixzadas por seguimento, es decir, en casos confirmados ya conocidos) realizadas que obtienen un resultado positivo. Este indicador mide la intensidad con la que se está haciendo una búsqueda activa de casos mediante las estrategias de control de brotes y rastreo de contactos.

Cuanto más intensamente se buscan casos entre personas asintomáticas, más bajo será el porcentaje de positivos.
Y a la inversa, si sólo se hace PCR/TAR en los casos sintomáticos, este porcentaje será más alto.

Riesgo de rebrote o EPG (índice de crecimiento potencial) 

 Se compone de dos elementos:

• La velocidad de reproducción media de los últimos 7 (ρ7) días que permite evaluar la velocidad de propagación de la enfermedad. La  calculamos como el cociente entre la media de los casos confirmados^# en los últimos res días con respecto a los casos confirmados de cinco días antes, también como media de tres días: ρt = (N(t) + N(t-1) + N(t-2))/(N(t-5)+ N(t-6) + N(t-7)). Posteriormente sacamos de media de los últimos 7 días.
• El segundo componente es la incidencia acumulada de los últimos 14 días (IA14) que se calcula como el número de casos nuevos del día actual más los casos de los 13 días anteriores por 100.000 habitantes. Esta incidencia permite estimar cuántas personas hay con capacidad de contagiar la enfermedad en un momento determinado (casos activos).

El EPG es el producto de los dos componentes anteriores:
EPG = ρ7*IA14

^#En este caso, para hacer los cálculos, se excluyen a los pacientes ingresados en residencias geriátricas porque tienen un comportamiento epidemiológico distinto.

Nos permite valorar el crecimiento de una epidemia.

Mide los posibles nuevos casos diagnosticables en los próximos 14 días y está relacionado con la probabilidad de aparición de nuevos brotes epidémicos.  

Se ha utilizado la metodología aportada por Computational Biology and Complex Systems. BIOCOMSC